《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
鲙残篇
素问上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合论篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九五藏生成篇第十五藏别论篇第十一异法方宜论篇第十二移
喉部论喉症喉症总论辨喉症经络治法喉科辨症双松症单松症双燕子症单燕子症双鹅症单鹅症双缠症单缠症悬蜞症合架症圹症瘰症乘枕症乘颚症斗底症HT症联珠症破头症掩头症大头症穿额症鱼鳞症玉笋症莲花症梅花症黑疔症抢食
灵药秘方
重刻《海上方》序暑月伤热伤寒咳嗽鱼脐疮口疮产难（一）妇人口干眼中流泪小便不快大便不快鼻中出血牙疼（一）远年咳嗽刺毒肿痛刀伤出血小儿骨痛水泻疮（一）痼冷蝇子入肠蚊虱破伤风急伤寒蛇伤犬伤心头疼龟病内瘴骨头
卷上痘疹发微惊风卷中论望色论芤脉论人参论***杂记卷下三疟治验神水治验制神水秘法妇科验方
脚气治法总要
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
陈序童序自序增补本草备要自序本草备要凡例药性总义内容草部黄甘草人参沙参丹参元参白术苍术葳蕤黄精狗脊石斛远志石菖蒲牛膝甘菊花五味子天门冬麦门冬款冬花紫菀旋复花百部桔梗荠马兜铃白前白芨半夏天南星贝母栝楼仁