正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
绪言卷一摄生第一阴阳第二脏象上第三脏象下第三卷二脉色上第四脉色下第四经络上第五卷三经络下第五标本第六气味第七论治第八卷四疾病第九病机邪气阴阳卷四疾病第十经脏虚实时令卷五疾病第十一五气情志风厥伤寒卷五疾
自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
痎疟论疏
医略
林序皇甫序序例卷一精神五脏论第一五脏变第二五脏六腑阴阳表里第三五脏六腑官第四五脏大小六腑应候第五十二原第六十二经水第七四海第八气息周身五十营四时十分漏刻第九营气第十营卫三焦第十一阴阳清浊精气津液血脉第
自序卷之一治法通论养血抑气抑气养血理气活血消积理气行血理气和血养血润燥温经之剂气血攻补备焉温经涩脱温经养血温经理气和血和血温经温经理气涩脱燥湿治错杂之邪攻积卷之一调经门经候总论辨色审多少先期后期调经平
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
序一序二卷之上杂病门疟消渴喉痛肠痈肩痈咳嗽疮疡瘾疹疥癣酒鼻健忘痨瘵咳血肺痿痿怖赫曦（?）温病手心热发热饮酒发热香港脚梦遗淋小便不通泄泻膈噎伤食卷之下大风痛风疝内伤中风暑注夏暑风湿郁病火溺血痰饮肺胗杂合
经络统序原始脏腑联系分合详说脏腑联系分合详说手太阴肺经（左右共二十二穴）手阳明大肠经（左右共四十穴）足阳明胃经（左右共九十穴）足太阴脾经（左右共四十二穴）手少阴心经（左右共十八穴）手太阳小肠经（左右共