序自序凡例卷一医中百误歌保生四要治阴虚无上妙方人参果医有彻始彻终之理内伤外感致病十九字火字解脉法金针寒热虚实表里阴阳辨医门八法论汗法论和法论下法论消法论吐法论清法论温法论补法伤寒纲领伤寒主治四字论经腑
明堂灸经
黄帝内经素问遗篇
辨症玉函
总论各论温病大纲逆传入营流连气分邪留三焦里结阳明卫、气、营、血看法论湿邪察舌白苔黄苔绛舌紫舌淡红舌黑苔验齿辨斑疹辨白疹论妇人温病
简介序卷一·温热论·续医案卷二·公选良方内外科卷三·公选良方卷四·公选良方
简介序卷一 内科卷二 妇人科卷三 小儿科卷四 外科卷五 通治
前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
简介序正文
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙