一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
自序卷上石膏滑石芒硝甘草黄人参桔梗术白头翁卷中黄连黄芩柴胡贝母细辛当归芎芍药牡丹皮茵陈蒿艾麻黄地黄葶苈大黄大戟甘遂附子半夏芫花五味子栝蒌实葛根防己卷下香豉泽泻薏苡仁薤白干姜杏仁大枣橘皮吴茱萸瓜蒂桂枝浓
叙一叙二叙三自叙卷上诸论辨正徐洄溪先生医者误人无罪论读王孟英治张养之久病伏邪医案论临症必先读书论治病当悉未病论烟痢宜通不宜塞论萝卜缨为治痢妙药论痰症随宜施治论治喉症宜分三大纲论喉症吹药论推摩法论治小儿
卷之一要书说六经图足太阳膀胱经手小肠足阳明胃经手大肠足卲阳胆经手三焦足太阴脾经手肺足少阴肾经手心足厥阴肝经手心胞伤寒纲领伤寒论伤寒标本表里虚实发表之药用温攻里之药用寒温里之药用热论十六种治法一 伤寒二
铜人鍼灸经
针邪密要
简介叙题辞序凡例卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八跋
卷上春温时疠湿温暑燥病寒病冬温疟疾卷下女科幼科痘科痧疹外科
总论调理精血论直指真源论男女服药论交会宜忌日诊妇人有妊歌妊娠杂病并产生死二歌余不能尽录也调元调经安胎便产转女为男法附方集验方广嗣附方附论一篇论童壮论衰老
原序上卷桂枝汤证桂枝汤证其一桂枝汤证其二桂枝汤证其三桂枝汤证其四（附列门人治验）桂枝汤证其五（附列门人治验）桂枝汤证其六（附列门人治验）麻黄汤证麻黄汤证其一麻黄汤证其二麻黄汤证其三麻黄汤证其四葛根汤证