正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
伤寒杂病论序伤寒论序自序后序卷首·仲景微旨 九章寒温异气传经大凡解期早晚寒热死生营卫殊病六经分篇六气司令一气独胜篇章次第卷一·脉法上篇 三十一章脉法上篇提纲脉法一脉法二脉法三脉法四脉法五脉法六脉法七脉
博物汇编艺术典医部全录之1博物汇编艺术典医部全录之2博物汇编艺术典医部全录卷001至卷046之1博物汇编艺术典医部全录卷001至卷046之2博物汇编艺术典医部全录卷001至卷046之3博物汇编艺术典医
黄庭内景五藏六府图
简介杂病·自叙杂病·卷第一 诸中门·诸伤门·寒热门杂病·卷第二 诸气门杂病·卷第三 诸呕逆门·诸血门杂病·卷第四 诸痛门·痿痹门杂病·卷第五 诸风门·神志门·杂门杂病·卷第六 大小腑门杂病·卷第七 七
叙凡例补益之剂（十首、附方七）四君子汤升阳益胃黄鳖甲秦艽鳖甲秦艽扶羸汤紫菀汤百合固金补肺阿胶小建中汤益气聪明汤发表之剂（十四首、附方八）麻黄汤桂枝汤大青龙汤小青龙汤葛根汤升麻葛根汤九味羌活十神汤神术散
卷上痘疹发微惊风卷中论望色论芤脉论人参论***杂记卷下三疟治验神水治验制神水秘法妇科验方
上卷临症以验舌为准统论验舌分虚实法验舌分阴阳法验舌分脏腑配主方法验舌决生死法临症以验舌为准结语下卷方略泻火清肝饮方滋水生肝饮方逍遥散加生地薄荷方逍遥散加丹皮山栀方十味温胆汤去枳实方当归建中汤去胶饴方七
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一