序凡例上品丹砂云母石钟乳矾石朴硝滑石禹余粮紫石英五石脂扁青菖蒲菊花甘草干地黄术菟丝子牛膝柴胡麦门冬车前子木香薏苡仁泽泻龙胆细辛石斛蓍实黄连黄肉苁蓉防风续断决明子丹参五味子蛇床子沙参菌桂松脂槐实柏实茯苓
序新刻药鉴卷之一寒热温平四赋，增补东垣未尽之意药性（寒门）药性（热门）药性（温门）药性（平门）新刻药鉴卷之一用药分根梢制药资水火用药丸散例解药毒法用药生熟法药性阴阳论病症标本论取方之法论各经补泻及专主
备急灸法景宋本
黄帝素问宣明论方
序先议病后用药极闸人定议病式论金道宾真阳上脱之症金道宾后案辨袁仲卿小男死证再生奇验并详诲门人辨黄长人伤寒疑难危证治验并详诲门人治金鉴伤寒死证奇验辨徐国祯伤寒疑难急证治验治钱仲昭伤寒发危证奇验治伤寒坏证
虚劳总论虚劳脉法虚劳死候虚劳所宜及养生之法虚劳所忌饮食诸物虚劳选方保阴煎六味地黄丸左归丸左归饮回生丸清金散加味清宁膏噙化丸天王补心丹归脾汤逍遥散仲淳验方乳金丹坤髓膏白凤膏（自制）四圣丸卫生膏资生丸大黄
洄溪医案
赵叙题词弁言苦口婆心语论湿温证用药之误麻证喉痛以喉证治之必死说附录天保采薇汤方急慢惊风辨产前以攻病为安胎说产后以甘温退虚热说为虚弱人及幼孩治实证遇当用克伐之药者宜早宜重说小儿难治之症有四说夹阴证邪说害
简介序受形本气平脉津润分体精血除疾审微辩书问子跋后序跋褚氏遗书后
概述卷一阴阳颠倒篇顺逆探原篇回天生育篇天人寿夭篇命根养生篇救母篇红铅损益篇初生微论篇骨阴篇卷二媾精受妊篇社生篇天厌火衰篇经脉相行篇经脉终始篇经气本标篇脏腑阐微篇考订经脉篇包络配腑篇卷三胆腑命名篇任督死